Powołanie tego kierunku studiów uzasadnione było koniecznością przygotowania specjalistów, którzy podejmują w praktyce zadanie poprawy stanu środowiska w Polsce, z uwzględnieniem obszarów wiejskich związanych z produkcją rolniczą oraz jego dostosowaniem do wymagań Unii Europejskiej.

Liczba godzin zajęć dydaktycznych wynosi 2520 i 1600 odpowiednio w trybie stacjonarnym i niestacjonarnym. Program studiów kierunku Ochrona Środowiska realizowany jest głównie w oparciu o kadrę pracowników i bazę laboratoryjno-dydaktyczną Wydziału Rolniczo-Ekonomicznego oraz innych wydziałów Uniwersytetu Rolniczego w Krakowie, w tym głównie Wydziału Inżynierii Środowiska i Geodezji. Program kształcenia obejmuje trzy grupy przedmiotów:

1. Grupa treści podstawowych, do których należą: język obcy, ekonomia, technologia informacyjna, przedmioty humanistyczne, matematyka, fizyka, chemia, biologia i mikrobiologia.
2. Grupa treści kierunkowych - wśród nich: ekologia i ochrona przyrody, geologia, geomorfologia i gleboznawstwo, hydrologia, meteorologia i klimatologia, środowiskowe funkcje lasów i użytków zielonych, zagrożenia cywilizacyjne i zrównoważony rozwój, biotechnologia środowiskowa i chemia środowiskowa. W grupie przedmiotów instrumenty ochrony środowiska proponowane są: ocena oddziaływania na środowisko, monitoring i systemy informacji przestrzennej. W ramach przedmiotów technologie w ochronie środowiska realizowane będą przedmioty: gospodarka wodno-ściekowa, gospodarowanie odpadami oraz ochrona powietrza, wód i gleb.
3. Grupa treści uzupełniających - obejmuje przedmioty fakultatywne o nachyleniu przyrodniczym i technicznym. Obejmują one takie przedmioty jak: wpływ produkcji rolniczej i ochrony roślin na środowisko, infrastruktura techniczna terenów wiejskich, rewaloryzacja środowiska w tym rekultywacja gruntów, renaturyzacja ekosystemów lądowych i wodnych oraz rewitalizacja terenów zurbanizowanych.

Studia te przygotowują kadry dla firm zajmujących się wszechstronną działalnością związaną z ochroną środowiska, w tym działających w ochronie środowiska rolniczego i jego otoczeniu. Absolwenci będą przygotowani do zajmowania się ochroną środowiska, do pracy w zakresie ochrony atmosfery, hydrosfery i litosfery, z uwzględnieniem obszarów wiejskich, zarówno Polski, jak i Unii Europejskiej. Absolwenci Ochrony Środowiska Wydziału Rolniczo-Ekonomicznego naszej Uczelni będą mogli podejmować efektywną współpracę ze specjalistami zajmującymi się planowaniem przestrzennym, różnorodną produkcją rolniczą oraz drobnym przemysłem i infrastrukturą techniczną. Program nauczania dostosowany jest do wymagań zrównoważonego rozwoju obszarów wiejskich, zapewniającego zaspokojenie potrzeb gospodarczych, cywilizacyjnych i kulturowych z równoczesną dbałością o środowisko.

Ponad 30% godzin w programie studiów stanowią fakultety. Możliwość wyboru przedmiotów poza programem obowiązkowym pozwala studentom na zdobywanie wiedzy uwarunkowanej indywidualnymi zainteresowaniami. Program studiów zapewnia opanowanie przynajmniej jednego języka obcego oraz poznanie i umiejętność wykorzystania technik komputerowych.

Praktyka zawodowa ma na celu zapoznanie studentów z organizacją działań i stosowanych technologii w ochronie środowiska, między innymi w zakresie oczyszczania ścieków, uzdatniania wody, składowania i gospodarczego wykorzystania odpadów, a także ze specyfiką produkcji rolniczej i związanych z nią zagrożeń dla środowiska. Studenci mogą odbywać praktykę zawodową w instytucjach państwowych i prywatnych oraz w innych jednostkach związanych z kierunkiem studiów. Część praktyki może odbywać się za granicą. Praktyka zawodowa dla studentów studiów niestacjonarnych może być realizowana jednorazowo lub student może ją podzielić na 2-3 części.